小分子Pulldown Ms靶点筛选
Candidate小分子靶点捕获技术介绍
一、服务简介
Candidate小分子靶点筛选,是利用小分子药物修饰标签,通过与细胞裂解液等样本孵育,pulldown捕获到与之相互作用的蛋白,然后经质谱鉴定生物学信息。以下是现有常见三种小分子修饰用于靶点筛选:
ABPP技术(activity-based protein profiling)
原理步骤: 药物分子光亲和偶联
点击化学


2. 生物素标记技术
原理步骤: 药物生物素标记
药物探针孵育、富集

3. 磁珠偶联法(CCCP)
原理步骤: 药物磁珠标记
药物探针孵育、富集

二、服务流程
(1)提供药物分子名称或Cas号,免费评估偶联策略(2-3工作日)
(2)提供30-50mg药物干粉(纯度95%以上)开展标记实验(2-3周)
(3)提供细胞裂解液样本,开展pulldown实验(1周)
(4)质谱鉴定(2-3周)
(5)数据处理及生信分析(1-2周)
三、合作案例
Candidate已和国内多家知名研究机构合作,共同完成数十个药物靶点筛选和药物胞内成像研究。
北京中医药大学——去氧紫草素靶点筛选
上海中医药大学附属龙华医院——黄芪皂苷靶点筛选
陕西中医药大学——羟基红花黄色素A靶点筛选
上海中医药大学——木通苯乙醇苷B
上海中医药大学附属曙光医院——金合欢素胞内成像
中国科学院上海药物研究所——人参三醇靶点筛选
中蒙医药研究院——消旋山莨菪碱靶点筛选、毛蕊花靶点筛选
四、项目示例结果:
(采用细胞为HepG2细胞)
从左至右依次为:1、marker 2、细胞裂解液(浓度为1.85mg/ml)
9、marker 10、marker
实验组1:3、药物beads与裂解液孵育后beads上样结果
4、药物beads与裂解液孵育后上清上样结果
对照组:(用150um药物预先封闭细胞裂解液3h)
5、药物beads与裂解液孵育后beads上样结果
6、药物beads与裂解液孵育后上清上样结结果
实验组2:7、药物beads与裂解液孵育后beads上样结果
8、药物beads与裂解液孵育后上清上样结果
结果分析:通过上述结果,发现偶联药物磁珠捕获到目的蛋白;而药物封闭组由于提前用游离的药物和细胞裂解液中目的蛋白结果,进而与偶联药物的磁珠竞争结合目的蛋白,因此条带有差异。


