热线电话:13764040366

诚信为本:市场永远在变,诚信永远不变。

联系我们

手机:13764040366
电话:13764040366
地址:上海市浦东新区园通路128号1号楼
邮箱:895428823@qq.com

技术服务

当前位置: 首页 > 技术服务

小分子Pulldown Ms靶点筛选

发布时间:2018-06-14 16:00:04点击量:

Candidate小分子靶点捕获技术介绍

一、服务简介

Candidate小分子靶点筛选,是利用小分子药物修饰标签,通过与细胞裂解液等样本孵育,pulldown捕获到与之相互作用的蛋白,然后经质谱鉴定生物学信息。以下是现有常见三种小分子修饰用于靶点筛选:

  1.  ABPP技术(activity-based protein profiling)

原理步骤: 药物分子光亲和偶联 image.png 点击化学

image.png

image.png

2. 生物素标记技术  

原理步骤: 药物生物素标记image.png药物探针孵育、富集

image.png

3. 磁珠偶联法(CCCP)

原理步骤: 药物磁珠标记image.png药物探针孵育、富集

 image.png

二、服务流程

(1)提供药物分子名称或Cas号,免费评估偶联策略(2-3工作日)

(2)提供30-50mg药物干粉(纯度95%以上)开展标记实验(2-3周)

(3)提供细胞裂解液样本,开展pulldown实验(1周)

(4)质谱鉴定(2-3周)

(5)数据处理及生信分析(1-2周)

三、合作案例

Candidate已和国内多家知名研究机构合作,共同完成数十个药物靶点筛选和药物胞内成像研究。

北京中医药大学——去氧紫草素靶点筛选

上海中医药大学附属龙华医院——黄芪皂苷靶点筛选

陕西中医药大学——羟基红花黄色素A靶点筛选

上海中医药大学——木通苯乙醇苷B

上海中医药大学附属曙光医院——金合欢素胞内成像

中国科学院上海药物研究所——人参三醇靶点筛选

中蒙医药研究院——消旋山莨菪碱靶点筛选、毛蕊花靶点筛选

四、项目示例结果:

image.png 

(采用细胞为HepG2细胞)

 

从左至右依次为:1、marker  2、细胞裂解液(浓度为1.85mg/ml)

                9、marker  10、marker

实验组1:3、药物beads与裂解液孵育后beads上样结果

4、药物beads与裂解液孵育后上清上样结果

对照组:(用150um药物预先封闭细胞裂解液3h)

5、药物beads与裂解液孵育后beads上样结果

6、药物beads与裂解液孵育后上清上样结结果

实验组2:7、药物beads与裂解液孵育后beads上样结果

8、药物beads与裂解液孵育后上清上样结果

结果分析:通过上述结果,发现偶联药物磁珠捕获到目的蛋白;而药物封闭组由于提前用游离的药物和细胞裂解液中目的蛋白结果,进而与偶联药物的磁珠竞争结合目的蛋白,因此条带有差异。