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蛋白构象变化研究

发布时间:2018-06-14 16:01:33点击量:

SERS分子构象鉴定技术

专业高效·省心又省力

 

1.技术简介

SERS表面增强拉曼散射(surface-enhanced Raman scatting),利用贵金属纳米结构表面局域表面等离子共振LSPR(Localized Surface Plasmon Resonance)效应,将分子变化信号放大108倍或更高,从而高灵敏检测生物分子结构及表达量变化。

Candidate提供专业的一站式SERS分子构象鉴定技术服务

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2.技术优势

超高灵敏度

可检测低至10⁻¹⁴ mol/L的浓度,甚至实现单分子检测

高选择性

每种分子拥有独特的“指纹谱”,避免误识别

无需复杂前处理

通常只需样品接触SERS基底即可进行检测

非破坏性检测

不改变样品本身,可用于生物样本、文物等敏感材料

空间分辨率高

原位检测分辨率可达μm级

3. 应用场景

1. 蛋白构象变化研究

2. 分子胶研究

3. 蛋白-蛋白相互作用

4. 酶抑制剂研究

5. 蛋白质构象改变病理研究

6. 药物细胞内分布研究

7. 血药浓度检测

 

4. 送样要求

l 蛋白样品:≥40ug,干粉或PBS体系(浓度≥ 1mg/ml)

l 小分子抑制剂:5-10mg,干粉,纯度≥ 95%

3. 案例展示:

        sers-10ul-80mW-10mS-Raman峰

  血管紧张素样蛋白                        血管紧张素样蛋白 给药30min  

图片10.png图片11.png  

1. 红移增强1580-1620  ΠΠ堆积或疏水作用

2. 酰胺III带 β-折叠1230-1240cm-1减弱、α-螺旋主导的1260cm-1增强

3. 参考文献:

1.Advanced Science;re-Training of Equivariant Graph Matching Networks with Conformation Flexibility for Drug Binding;HIV蛋白酶与抑制剂结合时,β-折叠特征峰(1670-1680cm-1)增强,提示局部结构刚性化

2.Journal of Medicinal Chemistry;In Silico Modeling and Scoring of PROTAC-Mediated Ternary Complex Poses;PROTAC三元复合物构象甄别

3.Journal of Chemical Information and Modeling;Holo-like and Druggable Protein Conformations from Enhanced Sampling of Binding Pocket Volume and Shape;T4噬菌体葡萄糖基转移酶结合UDP后,回转半径减小,对应CH伸缩峰强度升高,反应疏水腔压缩;辉瑞ADC团队通过SERS检测到曲妥珠单抗(抗HER2)Cys偶联位点的C-S伸缩峰(650cm-1)和S-S峰位移(从525→510cm-1),证实偶联导致二硫键构象从trans-gauche转为gauche-gauche